Metilfosfonska kislina je ena najbolj strukturno enostavnih spojin s C–P vezmi. Je predhodnik kompleksnejših fosfonatnih molekul, kot je glifosat.
Metilfosfonska kislina se uporablja za izdelavo diklorida metilfosfonske kisline s kloriranjem.
Metilfosfonska kislina naj bi bila pomembna v rekah in odprtem oceanu. Da bi izvedeli več o metilfosfonski kislini, je bila ustvarjena nova metoda za njeno merjenje. Metoda uporablja izotopsko označen notranji standard in pripravo vzorca, vključno s trdno fazno ekstrakcijo (SPE).
GC-MS je bil uporabljen za odkrivanje prisotnosti metilfosfonske kisline, potem ko je bila pretvorjena v drugo obliko z uporabo MTBSTFA. Študija primerja različne označene spojine in materiale SPE. Da bi pridobili več iz vzorcev vode z veliko soli, smo za odstranitev soli uporabili elektrodializo. Končno so bili analizirani vzorci vode iz različnih vodnih sistemov na nemškem obalnem območju Baltskega morja, da bi izvedeli več o metilfosfonski kislini v teh sistemih. V vzorcih je bila najdena nizka vsebnost metilfosfonske kisline.
Morska cianobakterija Prochlorococcus je običajen primarni proizvajalec in živi v tropskih in subtropskih morskih ekosistemih, kjer je hranilnih snovi malo. Ta študija kaže, da lahko Prochlorococcus MIT9301, najden v s fosfati osiromašenem severnem Atlantskem oceanu, uporabi metilfosfonat in hidroksimetilfosfonat za pridobivanje fosforja. Ti fosfonati se oksidirajo, da sprostijo metilno skupino, ki se nato izloči in uporabi za izdelavo purinov v RNA in DNA. Gene za predvideno fosfonatno oksidativno pot MIT9301 so večinoma našli v genomih Prochlorococcus iz delov severnega Atlantskega oceana, kjer je fosfata malo. To nakazuje, da se nekatere populacije Prochlorococcusa prilagodijo nizkim fosfatom z oksidacijo fosfonatov. Prej se je mislilo, da se metilfosfonska kislina razgradi le z bakterijsko CP liazno potjo, ki sprošča metan.
Nova pot za izdelavo formata iz metilfosfonske kisline je bila najdena v morski bakteriji Gimesia maris. To pot lahko najdemo tudi v Prochlorococcusu, vrsti bakterij, ki jih najdemo v oceanu. To kaže, da lahko format v okolju nastaja na različne načine in da ga lahko uporabljajo drugi organizmi. V oceanu, kjer je metilfosfonska kislina glavna sestavina raztopljene organske snovi, lahko oksidacija metilfosfonske kisline v format s Prochlorococcusom omeji proizvodnjo metana.